На что сможет претендовать муж, если я покупаю квартиру и состою с ним в официальном браке, а фактически не проживаю более двух лет?

Муж будет иметь право на 50% данной квартиры.

Также, возможно, и купить не получится, так как при таких дорогих покупках требуется предоставить письмо от второго супруга о том, что он не против этих трат (по законодательству бюджет семьи един).
Если ваша дочь и ее муж больше не собираются строить семью, то необходимо разводиться.

Если муж отказывается, или его местоположение неизвестно, то лучше обратиться за консультацией к юристу, как это лучше сделать. Насколько я слышал, надо собирать свидетелей, которые подтвердят, что они вместе не живут, и идти в суд.

Если с разводом все трудно, то можно попробовать сделать так, чтобы квартиру купили вы (мать) и подарили ее дочери. Возможно. в этом случае муж не будет иметь прав на нее. Но уточните у юриста.