Как лучше принимать таблетки?

Таблетка таблетке рознь.

Состав разный, различна и растворимость в воде. В идеале надо бы спросить у врача про конкретный препарат.
Растолочь и растворить - такой метод оправдан тем, что таблетка не лежит мертвым грузом в желудке и не раздражает его конкретный участок. Нагрузка, так сказать, более равномерная.
Но если таблетка растворяется до подхода к желудку - этого не потребуется.

Или к врачу, или - если Вы разбираетесь немного в органической химии и биохимии - смотрим состав и думаем, как такая таблетка себя ведет в организме.