Почему моему сыну с варикозом ставят годность А-1?

Вам необходимо почитать документ, который называется "Расписание болезней" и предназначен для определения готовности или неготовности к службе в рядах вооруженных сил России.

Вы можете самостоятельно найти его в интернете, или посмотреть на на сайтах призывников.

Как пользоваться расписанием болезней, посмотрите здесь - clck ru. Здесь же вы можете скачать его на свой компьютер. Или здесь посмотрите - www prizyv net
Читайте сразу раздел "Болезни системы кровообращения", статью 45, пункт "в".

К пункту "в" относятся:

- посттромботическая или варикозная болезнь нижних конечностей с явлениями хронической венной недостаточности 2 степени (периодическая отечность стоп и голеней после длительной ходьбы или стояния, исчезающая за период ночного или дневного отдыха);

Поэтому, для освобождения от службы вам придется доказать наличие у своего сына: варикозной болезни нижних конечностей (это имеется, как вы написали); хронической венной (венозной) недостаточности 2 степени.
При наличии этих двух заболеваний, вашего сына отнесут к категории годности "В".

В 2014 году вышло обновленное расписание болезней, которое значительно ужесточило требования к состоянию здоровья призывников. Некоторые распространенные заболевания, которые до этого момента являлись основной причиной освобождения от прохождения воинской службы, из списка исключены.